1. Kirche und Weltreligionen. Konzil und ökumenischer Rat in der Herausforderung der Weltreligionen (Inaugural-Dissertation Tübingen 1990).
2. Der notwendige Dialog. Die Weltreligionen in katholischer und evangelischer Sicht (Gütersloh (Gütersloher Verlagshaus) 1992) (= Studien zum Verstehen fremder Religionen Band 3, hrsg. von Jan Assmann und Theo Sundermeier).
3. "Gemeinsam gehen". Helfende Texte im Gespräch mit Kranken, Sterbenden und Trauernden für Pflegekräfte und Angehörige (Berlin (Wichern Verlag) 1992).
4. Art. Vergebung, in: Evangelisches Kirchenlexikon, Band 4, (Göttingen 1996), Sp. 1137-1143 (zusammen mit C. Gestrich).
5. Das Forum der Vergebung in der Kirche. Studien zum Verhältnis von Sündenvergebung und Recht (Habilitationsschrift, Band 10 der von W. Huber herausgegebenen Reihe "Öffentliche Theologie", Gütersloher Verlagshaus 1998). Rezension: Rheinischer Merkur vom 25. September 1998, Nr. 39, 29: "Befreiende Wirkung. Versöhnung setzt das Eingeständnis von Schuld voraus".
6. Rezension zu: Christine Axt-Piscalar, Ohnmächtige Freiheit. Studien zum Verhältnis von Subjektivität und Sünde (Tübingen 1996), in: ThLZ 122 (1997), Sp. 947-948.
7. Aufsatz: Schriftauslegung und Lehramt. Zusammenfassung der neueren ökumenischen Diskussion. Perspektiven aus evangelischer Sicht, in: ThLZ 123 (1998), Sp. 943-954.
8. Arbeitsbuch Systematische Theologie. Eine Methodenhilfe für Studium und Praxis (Gütersloher Verlagshaus 1998).
9. Rezension zu: Ralf K. Wüstenberg (Hg.), Wahrheit, Recht und Versöhnung. Auseinandersetzung mit der Vergangenheit nach den politischen Umbrüchen in Südafrika und Deutschland (mit einem Vorwort von Wolfgang Huber). Kontexte 24 (Frankfurt/M. u. a. 1998), in: Die Kirche. Berlin-Brandenburgisches Sonntagsblatt vom 6. Dezember 1998.
10. Paper: Der Täter-Opfer-Ausgleich im Strafrecht als Schnittstelle zwischen Ethik und Gesetzgebung. Analyse und theologische Perspektiven (Vortrag zur Jahrestagung der Societas Ethica 1998 in Turku (Finnland) "Ethik und Gesetzgebung/Ethics and Legislation"), in: Jahresbericht der Societas Ethica 1998, 202f.
11. Aufsatz: Neue Medien als Thema der Systematischen Theologie. Eine Problemskizze, in: Anne-Kathrin Finke und Joachim Zehner (Hgg.), Zutrauen zur Theologie. Akademische Theologie und die Erneuerung der Kirche (Berlin 2000), 121-133.
12. Aufsatz: Werner-Reihlen-Vorlesung. Ideen zu Beginn - Erfahrungen - Erwartungen, gemeinsam mit Helmut Reihlen, in: Anne-Kathrin Finke und Joachim Zehner (Hgg.), Zutrauen zur Theologie. Akademische Theologie und die Erneuerung der Kirche (Berlin 2000), 102-120.
13. Vorwort, gemeinsam mit Anne-Kathrin Finke, in: Anne-Kathrin Finke und Joachim Zehner (Hgg.), Zutrauen zur Theologie. Akademische Theologie und die Erneuerung der Kirche (Berlin 2000), V-VII.
Demnächst werden erscheinen:
14. Kirchenaustritt: Bilanz der Gespräche mit Ausgetretenen und Konzepte, in: Die Kirche. Berlin-Brandenburgisches Sonntagsblatt ...
15. Art. Sühne. ethisch, in: Theologische Realenzyklopädie (TRE).
16. Art. Entscheidung: II. Dogmatisch, in: Religion in Geschichte und Gegenwart, 4. Auflage (RGG4).
17. Art. Fundamentalismus: III. Systematisch-theologisch, 1. Fundamentaltheologisch, in: Religion in Geschichte und Gegenwart, 4. Auflage (RGG4).
18. Art. Fundamentalismus: III. Systematisch-theologisch, 2. Dogmatisch, in: Religion in Geschichte und Gegenwart, 4. Auflage (RGG4).
19. Art. Fundamentalismus: III. Systematisch-theologisch, 3. Ethisch, in: Religion in Geschichte und Gegenwart, 4. Auflage (RGG4).
20. Art. Heil: I. Religionsphilosophisch, in: Religion in Geschichte und Gegenwart, 4. Auflage (RGG4).
21. Art. Heil: III. Dogmatisch (inkl. biblisch), in: Religion in Geschichte und Gegenwart, 4. Auflage (RGG4).
22. Art. Versöhnung, in: Evangelisches Soziallexikon (Neuausgabe)
Zur Veröffentlichung vorgesehen:
23. Aufsatz: Welchen Sinn hat es heute, von menschlicher "Sühne" zu reden? Anselm von Canterburys Erlösungslehre ("Cur Deus homo") - gelesen im Anschluß an die neuere strafrechtliche, politikwissenschaftliche und rechtsphilosophische Diskussion.
24. Zum neuen Verständnis von Sündenvergebung in der Gegenwart (zugleich eine Auseinandersetzung mit E. Drewermann und D. Sölle). Vortrag gehalten zur Studientagung der Pastorenbruderschaft Nordwest (Baptisten).
25. Aufsatz: Was können Methodenschritte für die normative Aufgabe der Dogmatik leisten? Gibt es eine dogmatische Methode?
26. Aufsatz: Gottesdienst - Quelle der Theologie? Eine Auseinandersetzung mit Geoffrey Wainwrights systematischer Theologie des Gottesdienstes. Vortrag gehalten vor dem Forum für englischsprachige Theologie (Wissenschaftliche Gesellschaft für Theologie).
27. Aufsatz: Die politische Dimension der Vergebung - 11 Thesen zur evangelischen Friedensethik nach dem Kosovokonflikt, Vortrag vor der Führungsakademie der Bundeswehr Hamburg.
In Vorbereitung:
28. Buchveröffentlichung: Systematisch-theologisches Arbeitsbuch Neue Medien (s. auch Übersicht der Forschungsvorhaben).
29. Buchveröffentlichung: Arbeitsbuch Ethik. Eine methodische Einführung in die ethische Urteilsbildung (Gütersloher Verlagshaus, s. auch Übersicht der Forschungsvorhaben).
30. Digitale Publikation: Interdisziplinäres Repetitorium Neues Testament / Systematische Theologie als interaktive CD-ROM.
Gemeinsames Projekt von Prof. Dr. Jens Herzer (Neues Testament, Leipzig) und PD Dr. Joachim Zehner (Systematische Theologie), Humboldt-Universität Berlin (s. auch Übersicht der Forschungsvorhaben).